使当地各土邦投降，站稳了脚跟。
等到元朝末年，江南也陷入战乱，各路人马征战不休，大都朝廷无能为力。很多人就选择出海躲避，逃亡到元朝官府尚且存在的南洋地区。
后来，张士诚被朱元璋击败，支持者们纷纷逃亡，又出现了一次出海的高潮。作为张士诚的大金主之一，孙氏一族就是在这个时候，借助常年经营海运的优势，才得以及时逃走。几经辗转，最后在南洋落脚。
孙氏等大商人富可敌国，拥有自己的打手、家丁和船队。而在这年头，海商、海盗乃至海军，往往都是可以相互转换的身份。凭借这些实力，他们聚集起来，声称依然奉顺帝为主，用大元国号。因为重要据点在爪哇岛，所以也被称为“爪哇元”。
爪哇元和明朝的关系，相当不好。
孙氏这种直接打过仗的尚且不论，其他很多豪商巨贾也都颇有同感。元朝管理宽松，只要交了钱，别公然反叛，朝廷往往都懒得管，使他们的势力颇为庞大。像孙氏自己，即使老家丢失，凭借手里的船只，和家族在南洋长期经营来的商栈、船厂，依然可以称霸一方。
但明朝的管理，就严苛了很多。孙十万指出，官府限制商人的自由，剥夺他们对仆役的合法权力。朝廷索求无度，整日与民争利，夺取商人们费劲心力才积累下来的财富。开国之后，还限制航海，打压自由贸易，想自己垄断远洋贸易的暴利。
因此，江南的大商人，无不怀念大元。坚持使用元朝国号，也是因为如此。
明朝建国后，依然不断有人逃出国门，追求自由。没有逃跑的人，也有很多暗中和他们联系，平时帮忙走私商品，战时就通风报信，盼着大元天兵能打回来。
孙十万认为，这是人心所向，也是他们力量处于劣势，却还敢和明朝对抗的信心来源之一。
而这时，元朝封在云南的梁王，遭到明军攻击，战败逃入缅甸。缅甸的土王不欢迎梁王，双方一路交战。海商们看到机会，向流亡的梁王势力发出邀请，于是元军一路向东南进发，经暹罗进入占城，与爪哇海商们汇合，得到补给和支援。
越南陈朝也恐惧已经追入缅甸的明军，因此决定与他们联手。在众人的斡旋下，暹、越军队与元军、海商联合起来，击退了追击的明军。
然而，明朝如同上了头一样，就是不肯认输。两年后，另一支明军从北方攻入越南，一直打到国都升龙附近才被击退逐走。又过了四年多，好几路明军从云南、广西和海上，兵分多路赶来，联军这次终于招架不住。
升龙被明军攻占，梁王兵败自杀。越南陈朝不久被明朝取缔，其他各诸侯的残兵败将纷纷继续南逃。孙氏等人收罗了不少人马，再次泛舟出海逃走了。
好在，明军这次真的追不动了，给了他们一段喘息的时光。
