御体系彻底摧毁，原先为大明开疆拓土的秦王、晋王、燕王、代王、肃王等塞王，或被削去兵权，或被移镇内地。至此，终明一代，北方都城一直处于敌人威胁之下，不是让蒙古兵围就是让女真人围，所谓“天子守国门”，其实也是种无奈的说法······
如今北边许多大城都已荒废了，除了南京，也没有更合适的地方作为都城。
权宜之计，只有先定都南京。
八九月间，南京城中，几乎所有的南明官员都投降了，《明史》中对此有以下记载：
国破，（高）倬投缳死。
六月，南都破，百官皆好降。
当然，值此以齐代明之际，要说所有人都投降了大齐，显然也是不准确的，至少有六人选择为大明殉节。
这六人和南京国子监监生吴可箕相同，殉节是为了表达自己对亡国的痛惜。
吴可箕在南京关帝庙自缢而亡，留下一首诗：
蹇遇逃君臣，
临危犹保身。
操心死国难，
耻服北夷人。
广德元年夏秋之际，南京官员们成群结队前往武定皇帝大营，向齐军投降。
南明户部郎中刘成治对他夫人悲叹道：
“国家养士三百年，岂遂无一忠义，以报累朝恩？”
说完他也在家中自缢。
礼部官员黄端伯则选择了一种更为激烈的方式对抗大齐。
黄端伯是姜曰广的学生，他不仅拒绝逃亡广东——在那里，南明忠臣们扶立起一位年仅二十的桂王朱由榔为帝，继续与大齐为敌——而且，在广德皇帝召见他时，他竟然怀揣匕首行刺···
后世历史学家们，对那些在南京陷落之后继续反击大齐的南明忠臣们进行了赞颂，如朱继祚，他率残明势力在兴化，继续负隅顽抗，被杀；蒋若来，他率领民众在崇明岛截杀齐国往来官吏，并试图将这座后来大齐最繁华的海岛，打造成反齐复明分子的海上基地；再如郭维经，他本是朱常灜的户部尚书，在南京沦陷前逃往江西，后来死于临川保卫战····
类似这样的南明忠臣比比皆是，当然，投降大齐以换取身家性命富贵前程的人更多。
刘招孙三令五申，下令齐国官吏对投降明臣一视同仁不得加以蔑视，甚至特意在内阁八人组中增加了两个南明降臣，作为平衡。
尽管如此，齐国旧臣私底下对那些贪生怕死改换门庭的明人，表现出了相当的蔑视。
太上皇最不愿见到的南北朝臣之争，不可避免要出现了。
无论如何，刘招孙和他的大齐，终于胜利了，太上皇成为这片土地的主人，
