下，玛纳霏跟海之神殿一起，又重新回到了海底，消失了。
盖欧卡与其他的水系宝可梦们也离开了。
“我是杰克·渥卡，任务完成。”
杰克拿出手机跟总部汇报。
“我知道了，辛苦了。”
“应该还会再见面吧。”小遥舍不得玛纳霏。
这时，玛纳霏从海面上探出了头，然后又跳进了小遥的怀里，小遥激动地抱住了玛纳霏，开口道，
“要好好守护你的同伴哦，还有，不要忘记我，再见了，玛纳霏。”
“再见小遥，最喜欢你了。”玛纳霏说完，亲了小遥一口。
“啊，玛纳霏它，它居然会开口说话。”小遥惊喜道。
玛纳霏微微一笑，便又跳进了海里，这回是真的要说再见了。
“走了呢，玛纳霏。”小智道。
“没事吧，小遥。”小刚问道。
“怎么会没事，不过没关系。”小遥望着悬挂在海面上的夕阳，开口道。
之后，接到联络的君莎小姐带着警员们赶了过来，逮捕了幽灵以及他的海盗手下们。
杰克也与众人告别，返回巡护员联盟的总部去汇报情况去了。
小智一行人在乘坐着蓝湖礁号到离石英高原最近的一处港口之后，便跟广美一家人告别。
小智一行人接下来的目标，就是位于石英高原上的茴香谷。
因为小智收到亚希达的联络，神代先生已经收服到雷吉艾斯了，正在茴香谷那里等候着小智的挑战。
小智急不可耐，他已经迫不及待地想拿到最后一个开拓的小智象征了。
途中，一行人遇上了以成为搞笑艺人和讲宝可梦相声为目标的小杏和聒噪鸟。
在一处森林里面，小智一行人遇上了一位叫做川田的巡逻员。
他告诉小智一行人，有一只野生的玛狃拉会袭击过路的路人，让小智一行人小心一点。
经过调查，小智一行人得知，这只玛狃拉原本是住在这附近的一个玛狃拉和狃拉族群的领袖，但却被一只外来的玛狃拉给打败了，失去了首领的位置。
这只玛狃拉之所以会袭击过路的路人，是想向路人的宝可梦发起挑战，以此来让自己变强。
最终，在小智的鼓励下，这只玛狃拉成功击败了对手，拿回了自己领袖的位置。
告别了玛狃拉和川田，小智一行人终于抵达了茴香谷的宝可梦中心。
