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中医自己开办了一批中医学校，但却无法得到教育部的承认。
当时，有许多中医联名上书教育部，要求大学增设中医课程。
教育总长汪大燮公开表示：“吾国医毫无科学概要根据，余决意今后废去中医，不用中药。所请立案一节，难以照准。”这是当时政界对“废除中医”最为直接的表态。
第三次是1929年，果党政府中央卫生会议做出“以四十年为期，逐步废除中医”的决定。
1928年，当时的英格兰派员到华夏考察，发现华夏竟然没有卫生部，很是惊奇，国民政府闻知洋人意见，赶紧成立一个“中央卫生委员会”。
1929年2月23日至26日，果党政府召开了第一届中央卫生委员会会议，商讨此事。
但一个医疗卫生方面的会议，竟然不允许中医人士参加，与会者只有褚民谊、颜福庆、伍连德等当时的西医界名流，共14人。
一番讨论之后，得出一个结论：医生需要一定的医学、解剖学、生理学、病理学、微生物学知识，而中医从业者严重缺乏这方面的知识，因此中医不具备医生资格，国家应该逐步废除中医。
但考虑到目前国内西医数目有限，难以承担全国的医疗卫生职责，因此决定不搞一步到位，以40年时间为限，逐步废除中医。
留学倭国的余百之以医药学会上海分会会长的身份参加了会议。
会议讨论了余百之起草的《废止旧医以扫除医事卫生障碍案》。
这一提案除了“一个‘医学外行’次长和一两个参事抱怀疑态度外，其余是满场一致通过”。
许多人废除中医，仅仅止于泛泛的呼吁，而真拿中医开刀的是余百之。
他认为，中医学“是占星术和不科学的玄学”，“中医无明确之实验，无巩固之证据……不问真相是非合不合也……”总之，中医被余百之说得一无是处，甚至被诟为“杀人的祸首”。
因此，余百之主张坚决消灭中医，如不消灭中医，“不但妨碍民族的繁衍、民生的改良”，而且国际地位的“迁善”也无从谈起；“旧医一日不除，民众思想一日不变，新医事业一日不向上，卫生行政一日不能进展”。
