朱载坖将此事交给了申时行负责，要求申时行拟定详细的条款，将祠祭予以规范化。
而徐学谟回去之后，也以礼部尚书的名义向朱载坖上疏，认为王守仁就不必配享太庙了，同时朱载坖召见锦衣亲军都指挥使陆绎，命令他以扇惑人心、妄议朝政为罪名，缉捕何心隐、颜山农等所谓的大侠，朱载坖倒是想要知道，是这些大侠厉害，还是厂卫的番役缇骑厉害，但是朱载坖也命令陆绎，要好生对待这些人，千万要将他们或者送入京师，否则的话，将会引起轩然大波的，到时候朱载坖都不好保他。
徐学谟的奏疏上来之后，朱载坖随即就将徐学谟的奏疏下阁部商议，徐学谟在奏疏中认为，王守仁已经入祀孔庙了，在配享太庙，显然是于理不合，要么以功臣身份配享太庙，要么以儒学宗师身份入祀孔庙，不能同时入祀，因为太庙和孔庙都是大明最尊荣的祠祭，王守仁一人独享，是从未有过的事情，再加上现在王守仁已经入祀孔庙，将其撤出显然不妥，所以徐学谟的意思是罢配享之议，而存入祀之礼。
徐学谟以大宗伯的身份上疏，份量是很重的，首辅张居正也立即上疏予以支持，张居正在奏疏中说道：“旷典不可以不重，祠祭必得以专一。”
张居正认为既然王守仁已经入祀孔庙，对于儒臣来说，已经是天大的荣耀了，朝廷肯定了王守仁儒学宗师的地位，至于配享太庙，就不必再议了。
内阁也都是持这个意见，而朝廷之上反对王守仁配享太庙的官员们也纷纷上疏，要求如果是要商议王守仁配享太庙，就应该先将其从孔庙中迁出，这显然不是王门弟子们所希望看到的，在这种情况之下，朝廷之上关于王守仁配享一事的各种争论就更大了，所以内阁提请将此事先搁置，不能因为此事而影响朝廷的大典。
朱载坖也同意了内阁的提请，亲自下旨：“王守仁配享一事，众论纷纭，莫衷一是，姑容再议，速备大典。”
在大明，再议的意思不就是搁置嘛，朱载坖和内阁、礼部通过这种方式将此事予以搁置。
