礼部拿出仪注后，嘉靖五年九月十一日，朝臣五品以上文官、四品以上武官身着祭服，从午门外把献皇帝的灵位迎入世庙。
次辅石珤首先跳出来劝谏嘉靖阴阳有别，不要让章圣皇太后和陈皇后进世庙拜祭：“思乾坤阴阳之义，畏祖宗创建之法”；“抑其情以合于道”，嘉靖批复说“语欠酌量，非大臣体国师保爱君之心”。
九月十九日，圣母太后、皇后照仪注完成了祔庙之礼，嘉靖与即位后第一代内阁的破裂已摆在明面上。
先是费宏想调新宁伯谭纶去担任京军奋武营的坐营官，被翰林学士兼兵部侍郎张璁拒绝；一次经筵上，嘉靖兴致勃勃与几位阁老探讨诗词技巧并唱和几首后，桂萼第二天就对嘉靖道：“诗词小技，不值得浪费时间学习；诗言志，费宏得以窥伺陛下的意图。他不但专权纳贿不知悔改，而且不害怕陛下。”
身为紫禁城里新来的年轻人，嘉靖没有詹事府的从龙班底。武将可用的只有郭勋，文官可用的人一个巴掌都数得过来。文华殿里的太监都是潜邸旧人，嘉靖在台陛上来回走了几步道：“方献夫、霍韬无雄心壮志，陈洸又是一个小人，这三人躲在广东老家，皆不堪大用！只靠张秉用和你，哪天才能鼎新革故，中兴大明！”
张璁道：“陛下春秋鼎盛，不必急于一时。
既然子实与微臣凭议礼脱颖而出，那今后可不断制造议题以筛选出奸邪与忠贞，直到有足够的官员为陛下所用。”
嘉靖叹口气道：“我听人说：天下最容易的事，便是做官。倘若一个人连官都不会做，那他就太不中用了。
说这个话的，不过是当个两面人、裱糊匠罢了！不过你们说的对，先借张寅案清洗一批二、三、四品官吧！”
话说到这里，张璁、桂萼行礼告退。嘉靖凝视两人倒退出殿，沉默良久对张佐道：“你去让内阁拟旨，加礼部尚书席书为武英殿大学士。”
在职尚书加殿阁大学士是要入阁的。席书从病床上爬起来接了旨，第二天就上疏谢绝，甚至还请辞礼部尚书一职。
嘉靖以为席书走流程三辞三让，但席书的第二、第三封请辞奏疏写得并不客套，而是情真意切地求去。嘉靖非常失望，收到第三封奏疏的当晚，由骆安护卫安排，带着张佐黄锦，偷偷出宫前去席书府邸。
席书被锦衣卫扶着从卧室来到正堂给嘉靖见过礼，说过几句“陛下不以臣猥琐，感激涕零”的场面话后，嘉靖见席书双目无光，脸色灰黑，不禁悲哀。
最后一个跟父亲有交情的长辈亦要离世了！
“陛下，臣目不能视已是尸位素餐；北京四川山高水远，愿乞骸骨早日归乡，陛下亦应提前布局，找好接替之人。”
嘉靖盘算一下内阁及礼部尚书人选，问道：“张秉用推荐谢迁入阁，席先生你觉得怎么样？”
谢迁是浙江余姚人，孝宗时代的阁老。以品行高洁光明磊落着称。
谢迁虽然是状元出身，却不完全认可科举制，而是一心恢复被浙江前辈方孝孺倡导的举贤制。他入阁后，一口气提拔了老家余姚十几名不入俗流清高孤傲，因无心科举而没有秀才功名的高人隐士入京为官。武宗即位后，刘瑾立刻把那些高人全部充军发配到甘肃，并禁止余姚人今后入选京官。
刘瑾太监为了造反篡权当皇帝，对孝宗留下的顾命大臣，内阁阁老谢迁、刘健及尚书许进、马文升、刘大夏等数十名贤良痛下杀手，于正德初年迫不及待地将谢迁、刘健削籍为民赶出内阁，其他的尚书都被定罪流放，而且还追夺谢迁等阁老、刘大夏等尚书的出身以来所有文字。如果不是当时首辅李东阳据理力争，刘瑾甚至想把谢迁、刘健下狱抄家。
幸好朝中的正人君子于正德五年中秋之夜指挥京军、禁军将奸邪逆党一网打尽，刘瑾的种种倒行逆施才被拨乱反正，谢迁等上百名一、二品高官终于被恢复名誉及官身，返还家产。
嘉靖通读过翰林院编撰的孝宗、武宗实录，经筵上杨廷
