守到东扬州的会稽郡。东扬州是吴越的核心区域，北起会稽（今浙江省绍兴市附近），南至晋安（今福建省福州市附近），土地丰沃兵精粮足，民众反对侯景的意愿也很强烈，是个非常好的反攻基地。
可惜东扬州刺史南郡王萧大连啥本事都没有，大敌当前，天天只想着饮酒作乐，军事方面都放手交给了副手司马留异，而这个留异为人凶残狡诈，只想着趁机捞好处，别的什么都不管。侯景派宋子仙等人攻打吴地其它州郡的时候，萧大连和留异一直在边上看热闹，一个援兵都没派。
随着外围的吴郡、吴兴郡、富阳、钱塘接连失守，战火已经烧到了东扬州的边上。萧纶觉得照这个趋势发展下去东扬州肯定也守不住。
现在东扬州以及吴越地区的将领都看不惯萧大连的所作所为，心里都向着萧纶，但这也导致萧大连对萧纶产生了疑心，甚至暗地里打算下黑手除掉萧纶。所以现在摆在萧纶面前只有两条路，要么从萧大连手里把东扬州的军政大权抢过来；要么离开东扬州，另找根据地。
如果萧纶决定夺权，成功率虽然很大，但势必会导致叔侄之间反目成仇，萧纶现在的价值观无法接受这种局面，他最后还是选择了第二条路，带着部下离开东扬州。
可惜在当时那种局面下，萧纶的选择客观上没有带来任何好处。他离开没多久，宋子仙就打到了会稽城下。萧大连见势不好，直接弃城而逃，而留异不仅没有留下来坚守，反倒主动当了带路党，带着敌军一路追到信安（今浙江省衢州市附近），活捉了萧大连。
萧纶带着部下一路向西，寻找新的根据地。西边虽然没有吴越地区富庶，但这里是南梁的腹地，在战略纵深方面更有优势。
萧纶到达九江（今江西省九江市）的时候，江州刺史寻阳王萧大心打算把江州让给他。萧纶不想占侄子的便宜，继续沿着长江西上。
到达江夏的时候，郢州刺史南平王萧恪听说萧纶过来了，特意领着部下出城迎接。
萧恪是萧衍八弟萧伟的儿子，论起来算是萧纶的堂兄。他见到萧纶之后，当即要把郢州刺史的位置让给萧纶。
萧纶又拒绝了。他的目的是组织大家共同对付侯景，而不是偏安一隅当个割据的藩王。况且没有朝廷的正式任命，随随便便就自称刺史也不合规矩。
虽然萧纶没有接郢州刺史的位置，但他决定暂时留在郢州不再走了。郢州往西是湘东王萧绎的地盘，而萧绎生性多疑，萧纶担心产生误会。
得知萧誉正在被萧绎围攻的时候，萧纶心里很不是滋味。他很想去救萧誉，无奈自己的部队一路奔波两千多里，人马疲惫，军粮也严重短缺，更主要的是，他完全不能接受家族内部拔刀相向。
他给萧绎写了一封信，苦劝萧绎以大局为重，在当前社稷危难的时候，千万不可自相残杀。所谓天时地利，不及人和，手足肱支，岂可相害？纵然萧誉有过错，他毕竟是你的晚辈，你作为叔叔还是大度一点儿好。如果你对萧誉下死手，雍州的萧詧肯定会引魏兵入境以求自保，那时候内有乱党，外有强敌，咱们内部还不团结，整个国家就彻底没救了。
没多久，他就收到了萧绎的回信。萧绎完全不听劝，一点儿退兵的意思都没有，坚持要先灭萧誉，再去讨伐侯景。
萧纶把信扔在书案上，不禁涕泪横流，慨然长叹道：“天下之事，竟至于此！萧誉败后，萧绎的下一个目标应该就是我了吧。”
萧纶的预感很正确。两个月之后，萧誉终于没有顶住王僧辩的强大攻势，长沙城被攻破，他本人也被活捉。萧誉本来还想见萧绎一面，无奈萧绎根本就不给他机会。萧誉被当场处死，传首江陵。
平定湘州之后，萧绎简单休整了一段时间，马上又派王僧辩领兵东下，直奔郢州，号称要接萧纶去江陵。
萧纶知道这是冲自己来了。
他也实在有点儿气不过，给王僧辩写了一封信，指责王僧辩先杀萧绎的侄子，又来讨伐萧绎的六哥，以
