怀观望；六月初一，郑军进至江阴；十六日攻克瓜州，阵斩清游击左云龙，破满汉兵马数千，清操江巡抚朱衣助投降；二十二日在镇江银山大破清江宁巡抚蒋国柱、提督管效忠派来的援兵，清镇江守将高谦、知府戴可进献城投降；二十六日，张煌言带领的一支为数不多的舰队已进抵南京城下。一时间，长江中来往行驶的是郑军的战舰，两岸驰骋的是郑军的战马，各城镇都涌动着欢迎郑军的百姓，抗清形势呈现出从未有过的大好局面。清廷方面慌作一团，靖南将军喀喀木、江南江西总督郎廷佐密疏请求“速从京师调遣大兵前来，方可恢复瓜州，大江两岸城池亦不致失守”，“势甚猖獗，连日长驱，围困江宁，侵犯上游，大江南北各州县相继失守，内外信息不通几一越月”……漕运总督亢得时，在“不死于敌必死于法”的压力下，居然在往援南京的途中从船上跳入水中自尽。在巨大的压力面前，清廷急调上海、杭州等地驻军以及由云贵返回北京轮休的军队驰援南京。
镇江距南京不过百里之遥，部将甘辉建议“昼夜倍道，兼程而进”；其他将领却以“我师远来，不习水土，兵多负重，值此炎暑酷热，难责兼程之行也”，又提出正下大雨，河沟皆满，不利于行军，建议走水路。所谓“不习水土”、“炎暑酷热”，固然有理，但同以北方人为主的清军援兵相比，就很难说得过去。至于正逢大雨，不利陆路行军，更是一种借口，因为清军援兵赶赴南京的路程要远得多。朱成功竟然采纳了这一主张，决定由水路进发，从而失去了第一次战机。六月十八日晚上，由贵州返回北京休整的部分满洲八旗兵在梅勒章京噶褚哈、玛尔赛、吐尔玛率领下由荆州到达南京，增强了防守力量，大大振奋了城内的士气。清两江总督郎廷佐在题本中说：“自海逆于京口得志后，贼势大盛，于六月二十六等日，已溯江逼近江宁。时因城大兵分，力薄难支，幸由梅勒章京噶褚哈、玛尔赛、吐尔玛等率满洲兵自贵州前来，省城方得无虞”。
不过，这支清军数量有限，又是因出征日久由他部替换回北京休整的疲惫之军，南京清军的实力并没能增强太多，硬要打，郑军还是打得下来的。可郑军在占领镇江后，行动却异常缓慢。十几万大军所乘海船形体巨大，逆水而上，又不顺风，只能靠纤挽而行，十天之后（七月初九日）才到达南京仪凤门下。按理说，兵将既然是乘船而来，当不致旅途疲劳，稍事部署即可发起攻城。可这位国姓爷仍然慢吞吞地动作，七月十一日他率领大将甘辉、马信等数十人在几百名亲随侍卫保护下“绕观钟山，采踏地势”，十二日，成功率诸文武将士赴孝陵祭太祖，哭奠列宗。
“国姓，兵贵神速，现在可不是悲伤的时候，当速取金陵才是”，望着哭成一团的主上，中提督甘辉有些着急地说。
“嗯”，身经百战的朱成功自然知道一鼓作气的道理，点点头完成了祭拜。次日，“令甘辉、余新扎狮子山；万礼、杨祖扎第二大桥山；以翁天祐为救应，御仪凤门要路；马信、郭义、黄昭、萧拱宸屯扎汉西门，连林明、林胜、黄昌、魏雄、杨世德诸营垒。又令陈鹏、蓝衍、陈魁、蔡禄、杨好屯扎东南角，依水为营；刘巧、黄应、杨正、戴捷、刘国轩屯扎西北角，傍山为垒，连周瑞、林察、张名振等营。又令张英、陈尧策、林习山屯扎狱庙山，连诸宿镇护卫大营。各设鹿角了望，深沟木栅防御。江南一时震动”。不过，南京城是太祖高皇帝建都的地方，城垣非常广大，郑军虽有十几万也难将该城包围得水泄不通，如此部署，看似围住了南京，却让己方的兵力分散，变得单薄。
“国姓，伪清水师提督管效忠派人请降”，正准备下令攻城，前锋镇余新给这位国姓带来了一个好消息。“哦，让来使入帐”，朱成功点了点头。七月十一日，郑军曾截获管效忠给清廷的紧急求援疏，其中说：“海师二十余万、战船千余艘，俱全身是铁，箭射不透，刀斩不入。瓜、镇二战，败回者魂魄犹惊，策战皆鞠缩不前……现攻围南都，危如垒卵，乞发大兵南下救援扑灭，免致燎原焰天”。他阅后非常高兴，判断“南都必降”，当即
