。最直接的后果，是赵构对武将的猜忌心越来越重。他觉得苗傅、刘正彦都是武将，手里有兵就敢造反，以后得好好提防。
兵变平息后，赵构表面上对韩世忠、张俊等人加官进爵，暗地里却开始琢磨怎么收兵权。有一次，他对秦桧说：“朕夜里睡觉，枕头边都放着一把匕首，就怕武将学苗傅、刘正彦。”秦桧何等精明，立刻接话：“陛下圣明，武将们都是粗人，哪懂什么忠君爱国？还是文官可靠。”
这就为后来岳飞、韩世忠等人的悲剧埋下了伏笔。岳飞北伐时，赵构最怕的不是金兵，而是岳飞“直捣黄龙府”后迎回徽钦二帝，自己没位子坐。更怕的是岳飞手握重兵，万一学苗傅、刘正彦来个“清君侧”，那可不得了。所以他才会在岳飞大胜之际连发十二道金牌召回，最终以“莫须有”的罪名杀害。
另一个影响是，赵构对议和更加执着。他觉得兵变是因为自己抗金不力，导致武将不满，不如干脆议和，花钱买平安，这样武将就没理由闹事了。于是他重用秦桧，打压主战派，甚至不惜割地赔款，只要能保住自己的皇位。
苗刘兵变还间接导致了太子赵旉的死亡。这孩子当时才三岁，被折腾了一个月，受了惊吓，后来得了疟疾。宫女伺候时不小心踢翻了火盆，发出巨响，小太子当场吓死。赵构和皇后邢氏哭得死去活来，邢氏因为伤心过度，后来也没能再生育。赵构晚年只好从太祖一脉选了个孩子继承皇位，这就是宋孝宗。
关于“泥马渡康王”的传说，其实有很多版本。有的说泥马是南京应天府的土地神变的，有的说是崔府君显灵。但剥开神话的外衣，我们能看到更深层的东西——这其实是赵构为了证明自己“君权神授”而编造的故事。
赵构称帝时，合法性是个大问题。徽钦二帝还活着，只是被俘虏了，他这个“天下兵马大元帅”自立为帝，在讲究“正统”的古代，多少有点名不正言不顺。所以他需要神话自己，证明当皇帝是“天意”。于是，“泥马渡康王”的故事就出炉了，后来还被写进《宋史》，成了“正史”。
同样的手法在历史上很常见。刘邦说自己是母亲和龙交配生的，朱元璋说自己出生时红光满室，都是为了证明自己当皇帝是上天安排。赵构玩这手，只能说套路不深，却很有效。当时的老百姓文化水平低，就信这套，所以赵构的皇位才算坐稳了。
但话说回来，赵构也确实是命大。从金营逃脱，一路被金兵追杀，好几次都差点送命，最后居然能在江南建立南宋，延续宋朝国祚一百五十多年，不得不说有几分运气。不过他的运气都用在逃跑和保命上了，要是用在抗金上，说不定历史会是另一个样子。
