不知是否还会有更厉害的手段，村子的未来依旧充满未知。 就在大家对神秘老者的身份议论纷纷时，村子的水源突然被污染，村民们开始出现各种怪病。各家族意识到这又是黑暗势力的阴谋，迅速展开调查。与此同时，村子周边不断有奇怪的野兽出没，袭击村民。这些野兽似乎被某种力量操控，异常凶狠。
在调查水源污染的过程中，各家族发现了一些古老的咒文，和之前傀儡核心的符文有些相似。就在他们深入研究时，黑暗势力再次发动攻击，这次他们召唤出了被封印怪物的幻影。这幻影威力惊人，各家族的攻击对它只能造成轻微伤害。
正当大家陷入绝境时，神秘老者再次出现。他告诉众人，要彻底击败黑暗势力，需集齐三种圣物，以唤醒村子隐藏的守护力量。各家族没有丝毫犹豫，立刻踏上寻找圣物的征程，一场新的冒险就此拉开帷幕。 各家族分成三组，分别朝着三个不同的方向出发。日向一族凭借白眼的优势，负责寻找可能隐藏在地形复杂之处的圣物；奈良和山中家族联手，利用智慧和精神力量去探索神秘区域；秋道一族则凭借强大的体术，前往危险系数较高的地方。
日向组在一片古老的遗迹中发现了线索，却遭遇了机关陷阱和神秘忍者的阻拦。奈良组在阴森的森林里遇到了会幻术的妖物，险些迷失方向。秋道组在火山地带与熔岩怪兽搏斗。
就在大家都陷入困境时，神秘老者又适时出现，给予了一些隐晦的提示。经过一番艰难的探索，三组终于先后找到了圣物。可此时，黑暗势力也察觉到了他们的行动，派出大量高手前来抢夺。各家族带着圣物且战且退，回到村子后，迅速将圣物放置在指定位置。刹那间，村子隐藏的守护力量被唤醒，光芒四射，与黑暗势力展开了最终对决，一场决定村子命运的大战正式打响。
